条件付き独立性の下での処置効果¶
著者: Josef Perktold
このノートブックは、statsmodelsにおける新しい処置効果機能の基本的な使用法を示しています。
主要なクラスは statsmodels.treatment.treatment_effects.TreatmentEffect です。
このクラスは、ipw、ra、aipw、aipw-wls、ipw-raの5つの異なる方法を使用して処置効果と潜在的な結果を推定します。最後の3つの方法は、処置または選択モデルと結果モデルの両方を必要とします。 標準誤差と推論は、選択または処置モデル、結果モデル、および効果関数の共同GMM表現に基づいています。推論のアプローチは Stata に従いますが、Stata はより広範なモデルに対応しています。 推定と推論は、条件付き独立性または無視可能性の下で有効です。
現在、結果モデルはOLSに基づく線形モデルに制限されています。 処置は現在、Logit または Probit である二項処置に制限されています。
この例は Cattaneo に従っています。
[1]:
import os
import numpy as np
from numpy.testing import assert_allclose
import pandas as pd
from statsmodels.regression.linear_model import OLS
from statsmodels.discrete.discrete_model import Probit
from statsmodels.treatment.treatment_effects import (
TreatmentEffect
)
from statsmodels.treatment.tests.results import results_teffects as res_st
# Load data for example
cur_dir = os.path.abspath(os.path.dirname(res_st.__file__))
file_name = 'cataneo2.csv'
file_path = os.path.join(cur_dir, file_name)
dta_cat = pd.read_csv(file_path)
methods = ['ra', 'ipw', 'aipw', 'aipw_wls', 'ipw_ra']
methods_st = [
("ra", res_st.results_ra),
("ipw", res_st.results_ipw),
("aipw", res_st.results_aipw),
("aipw_wls", res_st.results_aipw_wls),
("ipw_ra", res_st.results_ipwra),
]
# allow wider display of data frames
pd.set_option('display.width', 500)
[2]:
dta_cat.head()
[2]:
| bweight | mmarried | mhisp | fhisp | foreign | alcohol | deadkids | mage | medu | fage | ... | prenatal | birthmonth | lbweight | fbaby | prenatal1 | mbsmoke_ | mmarried_ | fbaby_ | prenatal1_ | mage2 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | 3459 | married | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 24 | 14 | 28 | ... | 1 | 12 | 0 | No | Yes | 0 | 1 | 0 | 1 | 576.0 |
| 1 | 3260 | notmarried | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 20 | 10 | 0 | ... | 1 | 7 | 0 | No | Yes | 0 | 0 | 0 | 1 | 400.0 |
| 2 | 3572 | married | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 | 22 | 9 | 30 | ... | 1 | 3 | 0 | No | Yes | 0 | 1 | 0 | 1 | 484.0 |
| 3 | 2948 | married | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 26 | 12 | 30 | ... | 1 | 1 | 0 | No | Yes | 0 | 1 | 0 | 1 | 676.0 |
| 4 | 2410 | married | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 20 | 12 | 21 | ... | 1 | 3 | 1 | Yes | Yes | 0 | 1 | 1 | 1 | 400.0 |
5 rows × 28 columns
TreatmentEffect インスタンスの作成とIPWの計算¶
TreatmentEffect クラスには次のものが必要です:
結果モデルのOLSモデルインスタンス
選択モデルの結果インスタンス
処置指標変数
以下の例では、選択モデルとして Probit を使用します。Logit の使用もサポートされています。
[3]:
# treatment selection model
formula = 'mbsmoke_ ~ mmarried_ + mage + mage2 + fbaby_ + medu'
res_probit = Probit.from_formula(formula, dta_cat).fit()
# outcome model
formula_outcome = 'bweight ~ prenatal1_ + mmarried_ + mage + fbaby_'
mod = OLS.from_formula(formula_outcome, dta_cat)
# treatment indicator variable
tind = np.asarray(dta_cat['mbsmoke_'])
teff = TreatmentEffect(mod, tind, results_select=res_probit)
Optimization terminated successfully.
Current function value: 0.439575
Iterations 6
TreatmentEffect インスタンスを作成した後、五つのメソッドのいずれかを呼び出して、潜在的な結果である POM0、POM1 、平均処置効果(ATE)を計算できます。POM0 は処置なしのグループの潜在的な結果、POM1 は処置グループの潜在的な結果、処置効果はPOM1 - POM0です。
例えば、 teff.ipw() は逆確率加重法を使用してPOMとATEを計算します。処置の確率は、一般に傾向スコアとも呼ばれます。推定の summary には、POMとATEの標準誤差と信頼区間が含まれます。
標準誤差およびその他の推論統計量は、選択モデルと結果モデルの一般化方法(GMM)表現、および結果統計量のモーメント条件に基づいています。 メソッド ipw は選択モデルを使用しますが、結果モデルは使用しません。 メソッド ra は結果モデルを使用しますが、選択モデルは使用しません。 二重ロバスト推定量である aipw 、 aipw-wls 、 ipw-ra は選択モデルと結果モデルの両方を含み、そのうち少なくとも1つが正しく指定されていないと処置効果の一貫した推定は得られません。
ターゲット変数であるPOM0、POM1、およびATEのモーメント条件は、POM0とATEに基づいています。残りのPOM1は、POM0とATEの線形結合として計算されます。
内部のGMM結果は、 results_gmm として処置結果に添付されます。
デフォルトでは、処置効果メソッドは平均処置効果(ATE)を計算し、サンプル観測値の平均を取ります。 オプション effect_group を使用すると、 effect_group=1 で処置を受けたグループに対する平均処置効果(ATT)を計算したり、 effect_group=0 で処置を受けていないグループに対する平均処置効果を計算したりできます。
[4]:
res = teff.ipw()
res
[4]:
<class 'statsmodels.treatment.treatment_effects.TreatmentEffectResults'>
Test for Constraints
==============================================================================
coef std err z P>|z| [0.025 0.975]
------------------------------------------------------------------------------
ATE -230.6891 25.817 -8.936 0.000 -281.289 -180.089
POM0 3403.4632 9.571 355.586 0.000 3384.704 3422.223
POM1 3172.7741 24.001 132.193 0.000 3125.733 3219.815
==============================================================================
[5]:
res.summary_frame()
[5]:
| coef | std err | z | P>|z| | Conf. Int. Low | Conf. Int. Upp. | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ATE | -230.689070 | 25.816758 | -8.935633 | 4.048541e-19 | -281.288985 | -180.089154 |
| POM0 | 3403.463163 | 9.571412 | 355.586324 | 0.000000e+00 | 3384.703540 | 3422.222785 |
| POM1 | 3172.774093 | 24.001059 | 132.193085 | 0.000000e+00 | 3125.732881 | 3219.815305 |
[6]:
print(res.results_gmm.summary())
_IPWGMM Results
==============================================================================
Dep. Variable: y Hansen J: 3.988e-09
Model: _IPWGMM Prob (Hansen J): nan
Method: GMM
Date: Sat, 23 Mar 2024
Time: 10:53:17
No. Observations: 4642
==============================================================================
coef std err z P>|z| [0.025 0.975]
------------------------------------------------------------------------------
p 0 -230.6891 25.817 -8.936 0.000 -281.289 -180.089
p 1 3403.4632 9.571 355.586 0.000 3384.704 3422.223
p 2 -1.5583 0.461 -3.380 0.001 -2.462 -0.655
p 3 -0.6485 0.055 -11.711 0.000 -0.757 -0.540
p 4 0.1744 0.036 4.836 0.000 0.104 0.245
p 5 -0.0033 0.001 -4.921 0.000 -0.005 -0.002
p 6 -0.2176 0.050 -4.390 0.000 -0.315 -0.120
p 7 -0.0864 0.010 -8.630 0.000 -0.106 -0.067
==============================================================================
処置を受けた対象に対する平均処置効果(ATT)
下記をご覧ください。
[7]:
teff.ipw(effect_group=1)
[7]:
<class 'statsmodels.treatment.treatment_effects.TreatmentEffectResults'>
Test for Constraints
==============================================================================
coef std err z P>|z| [0.025 0.975]
------------------------------------------------------------------------------
ATE -225.1796 23.658 -9.518 0.000 -271.549 -178.811
POM0 3362.8393 14.198 236.855 0.000 3335.012 3390.667
POM1 3137.6597 19.071 164.526 0.000 3100.281 3175.038
==============================================================================
処置を受けていない対象に対する平均処置効果
[8]:
teff.ipw(effect_group=0)
[8]:
<class 'statsmodels.treatment.treatment_effects.TreatmentEffectResults'>
Test for Constraints
==============================================================================
coef std err z P>|z| [0.025 0.975]
------------------------------------------------------------------------------
ATE -231.8782 27.699 -8.371 0.000 -286.168 -177.588
POM0 3412.9116 9.283 367.634 0.000 3394.716 3431.107
POM1 3181.0334 26.120 121.786 0.000 3129.840 3232.227
==============================================================================
ATEを計算する他の方法は、例えば回帰調整(ra)や二重ロバスト(ipw_ra)のように、 ipw と同様の方法で機能します。
[9]:
res_ra = teff.ra()
res_ra
[9]:
<class 'statsmodels.treatment.treatment_effects.TreatmentEffectResults'>
Test for Constraints
==============================================================================
coef std err z P>|z| [0.025 0.975]
------------------------------------------------------------------------------
ATE -239.6392 23.824 -10.059 0.000 -286.333 -192.945
POM0 3403.2423 9.525 357.288 0.000 3384.573 3421.911
POM1 3163.6031 21.864 144.698 0.000 3120.751 3206.455
==============================================================================
[10]:
res_ra.summary_frame()
[10]:
| coef | std err | z | P>|z| | Conf. Int. Low | Conf. Int. Upp. | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ATE | -239.639211 | 23.824021 | -10.058722 | 8.408247e-24 | -286.333435 | -192.944988 |
| POM0 | 3403.242272 | 9.525207 | 357.288006 | 0.000000e+00 | 3384.573209 | 3421.911335 |
| POM1 | 3163.603060 | 21.863509 | 144.697867 | 0.000000e+00 | 3120.751371 | 3206.454750 |
[11]:
ra2 = teff.ipw_ra(effect_group=1, return_results=True)
ra2.summary_frame()
[11]:
| coef | std err | z | P>|z| | Conf. Int. Low | Conf. Int. Upp. | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ATE | -223.545262 | 23.794008 | -9.395023 | 5.720507e-21 | -270.180660 | -176.909864 |
| POM0 | 3361.204984 | 14.465009 | 232.367989 | 0.000000e+00 | 3332.854088 | 3389.555880 |
| POM1 | 3137.659722 | 19.070923 | 164.525844 | 0.000000e+00 | 3100.281400 | 3175.038045 |
TreatmentEffect のすべてのメソッド¶
以下は、すべてのメソッドに対して ATE と POM を計算し、表示します。 (TreatmentEffect の呼び出しもリマインダーとして含まれています。)
[12]:
teff = TreatmentEffect(mod, tind, results_select=res_probit)
for m in methods:
res = getattr(teff, m)()
print("\n", m)
print(res.summary_frame())
ra
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -239.639211 23.824021 -10.058722 8.408247e-24 -286.333435 -192.944988
POM0 3403.242272 9.525207 357.288006 0.000000e+00 3384.573209 3421.911335
POM1 3163.603060 21.863509 144.697867 0.000000e+00 3120.751371 3206.454750
ipw
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -230.689070 25.816758 -8.935633 4.048541e-19 -281.288985 -180.089154
POM0 3403.463163 9.571412 355.586324 0.000000e+00 3384.703540 3422.222785
POM1 3172.774093 24.001059 132.193085 0.000000e+00 3125.732881 3219.815305
aipw
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -230.989648 26.214445 -8.811541 1.234375e-18 -282.369017 -179.610280
POM0 3403.355674 9.568514 355.682783 0.000000e+00 3384.601731 3422.109616
POM1 3172.366025 24.427402 129.869153 0.000000e+00 3124.489197 3220.242854
aipw_wls
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -227.195618 27.372036 -8.300282 1.038644e-16 -280.843822 -173.547414
POM0 3403.250651 9.596571 354.631943 0.000000e+00 3384.441717 3422.059585
POM1 3176.055033 25.654641 123.800406 0.000000e+00 3125.772859 3226.337206
ipw_ra
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -229.967078 26.629411 -8.635830 5.830196e-18 -282.159765 -177.774391
POM0 3403.335639 9.571288 355.577620 0.000000e+00 3384.576260 3422.095018
POM1 3173.368561 24.871955 127.588224 0.000000e+00 3124.620425 3222.116697
Stata の結果¶
statsmodels の結果は Stata の結果と非常に近いです。なぜなら、両方のパッケージは同じアプローチを使用しているからです。
[13]:
for m, st in methods_st:
print("\n", m)
res = pd.DataFrame(st.table[:2, :6], index = ["ATE", "POM0"], columns=st.table_colnames[:6])
print(res)
ra
b se z pvalue ll ul
ATE -239.639211 23.824021 -10.058722 8.408247e-24 -286.333435 -192.944988
POM0 3403.242272 9.525207 357.288005 0.000000e+00 3384.573209 3421.911335
ipw
b se z pvalue ll ul
ATE -230.688638 25.815244 -8.936140 4.030006e-19 -281.285586 -180.091690
POM0 3403.462709 9.571369 355.587873 0.000000e+00 3384.703170 3422.222247
aipw
b se z pvalue ll ul
ATE -230.989201 26.210565 -8.812828 1.220276e-18 -282.360964 -179.617438
POM0 3403.355253 9.568472 355.684297 0.000000e+00 3384.601393 3422.109114
aipw_wls
b se z pvalue ll ul
ATE -227.195618 27.347936 -8.307597 9.765984e-17 -280.796587 -173.594649
POM0 3403.250651 9.596622 354.630065 0.000000e+00 3384.441618 3422.059684
ipw_ra
b se z pvalue ll ul
ATE -229.967078 26.626676 -8.636718 5.785117e-18 -282.154403 -177.779752
POM0 3403.335639 9.571260 355.578657 0.000000e+00 3384.576315 3422.094963
推定なしの処置効果¶
標準誤差や推測統計を計算せずに、POM(平均処置効果)とATE(平均処置効果)を計算することが可能です。この場合、GMM モデルは計算されません。
[14]:
for m in methods:
print("\n", m)
res = getattr(teff, m)(return_results=False)
print(res)
ra
(-239.6392114643363, 3403.2422719354845, 3163.603060471148)
ipw
(-230.6886377952615, 3403.462708684556, 3172.774070889295)
aipw
(-230.98920111257803, 3403.355253173835, 3172.366052061257)
aipw_wls
(-227.19561818674856, 3403.2506509757864, 3176.055032789038)
ipw_ra
(-229.96707793513042, 3403.335639307419, 3173.3685613722887)
処置群への処置効果¶
aipw および aipw-wls では、サブグループへの処置効果は利用できません。
effect_group は、処置効果と潜在的な結果が計算されるグループを選択します。1 は処置群への平均処置効果(ATT)を、0 は非処置群への平均処置効果(ATU)を指定します。注:pandas のDataFrame、POM および ATE の行ラベルは、サブグループへの処置効果においても同じです。
[15]:
for m in methods:
if m.startswith("aipw"):
continue
res = getattr(teff, m)(effect_group=1)
print("\n", m)
print(res.summary_frame())
ra
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -223.301651 22.742195 -9.818826 9.342545e-23 -267.875534 -178.727767
POM0 3360.961373 12.757489 263.450069 0.000000e+00 3335.957154 3385.965592
POM1 3137.659722 19.070923 164.525844 0.000000e+00 3100.281400 3175.038045
ipw
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -225.179608 23.658119 -9.518069 1.764269e-21 -271.548669 -178.810546
POM0 3362.839334 14.197866 236.855264 0.000000e+00 3335.012028 3390.666640
POM1 3137.659726 19.070923 164.525845 0.000000e+00 3100.281404 3175.038049
ipw_ra
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -223.545262 23.794008 -9.395023 5.720507e-21 -270.180660 -176.909864
POM0 3361.204984 14.465009 232.367989 0.000000e+00 3332.854088 3389.555880
POM1 3137.659722 19.070923 164.525844 0.000000e+00 3100.281400 3175.038045
未処置群への処置効果¶
ATT と同様に、オプション effect_group=0 を使用することで、未処置群への平均処置効果を計算できます。
[16]:
for m in methods:
if m.startswith("aipw"):
# not available
continue
res = getattr(teff, m)(effect_group=0)
print("\n", m)
print(res.summary_frame())
ra
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -243.375488 24.902030 -9.773319 1.465697e-22 -292.182569 -194.568406
POM0 3412.911593 9.283454 367.633804 0.000000e+00 3394.716358 3431.106829
POM1 3169.536106 23.128805 137.038471 0.000000e+00 3124.204480 3214.867731
ipw
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -231.878176 27.699436 -8.371224 5.702293e-17 -286.168073 -177.588279
POM0 3412.911593 9.283454 367.633804 0.000000e+00 3394.716357 3431.106829
POM1 3181.033418 26.119760 121.786473 0.000000e+00 3129.839629 3232.227206
ipw_ra
coef std err z P>|z| Conf. Int. Low Conf. Int. Upp.
ATE -231.125972 28.813022 -8.021580 1.043933e-15 -287.598458 -174.653487
POM0 3412.911593 9.283454 367.633805 0.000000e+00 3394.716358 3431.106829
POM1 3181.785621 27.301318 116.543297 0.000000e+00 3128.276021 3235.295221
TreatmentEffect クラスとそのメソッドのドクストリングは、次のコマンドを使用して取得できます。
help(teff)